肿瘤新生抗原
T细胞免疫反应的特异性由结合在细胞表面的人类白细胞抗原（HLA）分子上的肽段调控。正常健康细胞呈现的肽段通常避开T细胞反应，然而，肿瘤细胞或病毒感染细胞通常呈现额外的新肽段（新抗原），这些肽段在正常细胞表面不存在，并有可能触发T细胞反应。因此，鉴定HLA肽组学和新抗原可能为癌症治疗提供潜在的免疫治疗靶点。目前，基于下一代测序（NGS）和RNA-Seq数据的新抗原鉴定和HLA表位预测面临重大挑战，并且常常伴随着高假阳性和假阴性率。基于质谱（MS）的实验方法可能为准确鉴定新抗原和HLA表位提供重要的手段。
我们已开发了有效方法来分离HLA-I和HLA-II相关的肽段，并开发了超高灵敏度的NanoLC-MS/MS平台和软件工具，用于鉴定和定量HLA相关的肽段。为避免因癌症NGS和RNA-Seq限制而导致的假阴性鉴定，我们还开发了计算平台，可在没有NGS或RNA-Seq数据的情况下对HLA相关的肽段进行全新序列鉴定。由于mRNA脂质体很可能是基于新抗原的肿瘤疫苗中最有前途的技术，我们开发了DNA模板质粒系统，用于在T7 RNA聚合酶启动子下体外转录具有polyA尾的mRNA。我们还高产地开发和生产了所需要的酶（T7 RNA聚合酶、加帽酶、O-甲基转移酶、DNase、RNA酶抑制剂等）用于体外转录。我们的目标是为客户提供一体化的新抗原发现和肿瘤疫苗开发服务。 Sample Requirement: 提供试量的细胞或组织样本。对于肿瘤新生抗原检测，还需提供全外显子测序（WES）和/或RNA-Seq。
我们已开发了有效方法来分离HLA-I和HLA-II相关的肽段，并开发了超高灵敏度的NanoLC-MS/MS平台和软件工具，用于鉴定和定量HLA相关的肽段。为避免因癌症NGS和RNA-Seq限制而导致的假阴性鉴定，我们还开发了计算平台，可在没有NGS或RNA-Seq数据的情况下对HLA相关的肽段进行全新序列鉴定。由于mRNA脂质体很可能是基于新抗原的肿瘤疫苗中最有前途的技术，我们开发了DNA模板质粒系统，用于在T7 RNA聚合酶启动子下体外转录具有polyA尾的mRNA。我们还高产地开发和生产了所需要的酶（T7 RNA聚合酶、加帽酶、O-甲基转移酶、DNase、RNA酶抑制剂等）用于体外转录。我们的目标是为客户提供一体化的新抗原发现和肿瘤疫苗开发服务。 Sample Requirement: 提供试量的细胞或组织样本。对于肿瘤新生抗原检测，还需提供全外显子测序（WES）和/或RNA-Seq。
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