肽谱图全序列测定 (Peptide Mapping)
LC-MS/MS的肽谱图分析服务,主要用于蛋白质一级结构的确认,通过使用多种蛋白质酶切反应和液质联用技术对肽段的测序,我们开发了专有的软件,能对任何非特异性蛋白酶酶解产物的质谱数据进行分析。我们保证100%的序列覆盖以及高精度的序列确认。
步骤:
在肽谱图比对服务中,每个蛋白质样品都用2-4个蛋白质酶进行酶切(具体取决于蛋白质的序列);得到的肽段混合物再经由LC-MS/MS进行分析。每一组酶解产物的质谱数据经由我们专有的PepMap软件进行搜索分析,再将所有酶解的搜索结果进行汇总达到蛋白质序列100%的覆盖率。
优势:
1)特异性及非特异性蛋白质酶的组合使用保证了我们对于任何蛋白质都可以达到100%的覆盖率。
2)每个肽段的确认是基于它的质量以及它的MS/MS指纹图谱,所以比仅使用一级质谱更精准。
样品要求:我们一般需要纯度超过80%的蛋白质20微克来进行该项分析。我们也接受蛋白质胶样品,不过跑胶之前需要对样品进行特殊处理。
样品周期:平均2周
价格:肽谱图比对项目的价格取决于该蛋白质的大小,序列特征,纯度以及样品量,因为我们需要这些信息以便确定每个样品优化的实验步骤。请给我们发送以上样品信息,我们会在12个小时内给予正式报价。如果您在发送样品信息前需要我们签署保密协议,也请与我们联系。
结合肽谱图:
1)证实蛋白质一级结构(氨基酸序列)包括其 N和C端。
2)提供蛋白质修饰基团的位点和比例,如糖基化,二硫键,乙酰化,硫酸盐化和磷酸化。
3)提供有关的蛋白质降解产物的定性和定量信息。
4)包括提供蛋白质氧化和脱氨基化的信息。