肿瘤疫苗是目前肿瘤免疫疗法的前沿。新抗原的精准鉴定，直接决定肿瘤疫苗的临床疗效，也是当前研发最大瓶颈。行业主流方案依赖患者DNA开展二代测序（NGS）识别突变，再通过生物信息软件预测新抗原肽段，但该技术路线存在准确率不足、抗原覆盖不全、成本高昂等诸多局限。

为突破这一痛点，普泰生物（ProtTech）打造全球首创基于 MHC 肽组学的肿瘤新抗原发现技术：无需肿瘤 DNA 测序数据，即可完成新抗原氨基酸序列从头测序（De Novo Sequencing）。 本技术不仅可鉴定来自人类基因组蛋白编码区、非编码区的新抗原，还能识别由人类病毒基因组产生的新抗原。同时，公司自主搭建 mRNA 疫苗核心原料平台，自研 mRNA 生产载体系统及全套 mRNA 疫苗工具酶，包含 T7 RNA 聚合酶、mRNA 加帽酶、O - 甲基转移酶等，支撑 mRNA 肿瘤疫苗完整研发链条。

技术优势｜MHC 肽组学 VS NGS 预测技术

１、更高准确性 技术直接对 MHC 呈递肽段实测测序，新抗原鉴定可达 100% 准确率。传统 NGS 方案依靠患者 HLA 分型进行软件预测；人群 HLA 分型高达约 45000 种，算法预测假阳性高，临床准确性受限。

２、更完整的抗原覆盖 NGS 仅比对肿瘤与正常细胞 DNA 差异，只能从占基因组 1.5% 的蛋白编码区推测突变抗原。大量真实新抗原来自 98.5% 的非编码区、无突变基因异常转录 / 翻译产物（如癌 - 睾丸抗原），极易被 NGS 遗漏。 MHC 肽组学直接捕获细胞表面真实呈递的 MHC 多肽，可检出编码区、非编码区、异常转录翻译产物、病毒来源全部新抗原。

３、显著降低研发成本与周期 传统 NGS 需要对肿瘤 + 正常配对基因组（合计约 32 亿碱基）深度测序、生信分析与验证，流程冗长。普泰 MHC 肽组学方案仅通过 LC-MS 液相色谱 - 质谱联用，对 10~20 氨基酸短肽（约 1000–2000 条）直接测序，大幅压缩研发时间、降低项目成本。

我们已与赛默飞（Thermo）及多家美国企业在MHC肽组学分析领域开展了多年的深度合作（Ref.1）。如果您对普泰生物（ProtTech）的新抗原研发与肿瘤疫苗开发业务感兴趣，请与我们联系。

Reference 1: Shih, N.R., Nong, T., Murphey, C. et al. HLA class I peptide polymorphisms contribute to class II DQβ0603:DQα0103 antibody specificity. Nat Commun 15, 609 (2024) [Abstract]